L 77 - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 185: Spm. om de nærmere forhold vedrørende den minkfarm, som blev gensmittet med corona, efter der havde været konstateret antistoffer hos minkene, til sundheds- og ældreministeren

Miljø- og Fødevareudvalget 2020-21
L 77
Offentligt

18. november 2020

Notat om den seneste udvikling af SARS-CoV2 på minkfarme og blandt

mennesker

Notatet omfatter følgende afsnit:



Udvikling af SARS-CoV2 smittede farme

Påviste tilfælde af SARS-CoV2 blandt personer med tilknytning til minkproduktion

Regional forekomst af SARS-CoV-2 positive personer, sekventerede prøver og minkvarianter

Beskrivelse af smitte med SARS-CoV-2 minkvariant virus, cluster 5

Beskrivelse af minkfarm smittet med SARS-CoV-2 for anden gang

Sammenfatning

På landsplan er der de seneste uger set en stigning i antal smittede minkfarme i Region Midtjylland og

Syddanmark. Parallelt med dette ses en stigning i andelen af personer, der har tilknytning til

minkproduktion, der får påvist SARS-CoV-2 i de regioner. Stigningen er særligt udtalt i Region Midtjylland i

uge 46. På baggrund af nye sekventeringsresultater op til uge 45 ses, at andelen af minkvarianter blandt

sekventerede prøver i hele landet er en anelse lavere i uge 45 (5%) i forhold til uge 44 (6 %). Andelen af

tilfælde smittet med minkvarianter i Region Nordjylland er lidt højere i uge 45 (28%) i forhold til uge 44

(20%), men det estimerede antal smittede med minkvarianter er på samme niveau, da der også er set et

betydeligt fald i antallet af bekræftede tilfælde. Andelen af smittede med minkvarianter i Region

Midtjylland er på 9% i uge 45 i forhold til 12% i uge 44. Det vurderes dog, at denne andel vil stige de

kommende uger. I de øvrige regioner ses kun sporadiske tilfælde af personer smittet med minkvarianter i

befolkningen som helhed. Der er ikke påvist yderligere tilfælde af minkvariant med cluster 5 siden 15.

september 2020, hvorfor SSI nu vurderer, at denne variant med stor sandsynlighed er døet ud. Den første

farm, der blev smittet, efter man overgik til en strategi, hvor man ikke aflivede mink, blev smittet medio

august. Denne farm blev ved prøver udtaget d. 2. og 6. november konstateret smittet med SARS-CoV-2

igen. Sekvensresultater fra minkene viser, at smitten sandsynligvis skyldes samme stamme, som

besætningen oprindeligt var smittet med.

Udvikling af smittede farme

Den 17. november 2020 har i alt 283 minkfarme været smittet, og 22 er under mistanke, men endnu ikke

bekræftet smittede. Antallet af farme med aflivede smittede besætninger er 265 (Fødevarestyrelsen).

Mens antallet af smittede farme i Region Nordjylland er faldende, ses en stærkt stigende forekomst af

smittede farme i Region Midtjylland i uge 46 og begyndelsen af uge 47, og en fortsat stigende forekomst af

SARS-CoV-2-positive farme i Region Syddanmark (figur 1).

L 77 - 2020-21 - Endeligt svar på spørgsmål 185: Spm. om de nærmere forhold vedrørende den minkfarm, som blev gensmittet med corona, efter der havde været konstateret antistoffer hos minkene, til sundheds- og ældreministeren

Figur 1:

Procentvis forekomst af SARS-CoV-2-positive minkfarme pr uge, fordelt på regioner (tal fra FVST).

Den udbredte geografiske spredning, der er sket siden uge 39, betyder, at der de seneste uge er sket en

øgning i antal smittede farme i flere kommuner samtidigt, hvor udbruddet i Nordjylland udviklede sig i få

kommuner først (Hjørring, Frederikshavn), før det spredte sig til andre kommuner (figur 2).

Figur 2:

Kumuleret forekomst af SARS-CoV-2-positive minkfarme pr uge, fordelt på kommuner (tal fra

FVST).

Som det ses af figur 2, udviklede antallet af smittede farme i Hjørring og Frederikshavns kommuner sig, i

begyndelsen med lav, men siden med stigende hastighed. I Jammerbugt kommune blev smitten

introduceret i et meget minktæt område på Gjøl, hvilket sandsynligvis er grunden til den meget bratte

stigning i denne kommune. Som det fremgår af figur 2, blev enkelte minkfarme i 19 yderligere kommuner

smittet i perioden fra uge 39 til 45. De to kommuner med flest minkfarme i Danmark, Holstebro og

Ringkøbing-Skjern var blandt disse. En samtidig spredning af smitte fra de første smittede farme i flere

kommuner i Region Midtjylland, var formentlig forklaringen på den bratte stigning i såvel smittede farme,

som stigningen i antallet af personer med tilknytning til minkfarme (figur 3).

Påviste tilfælde blandt personer med tilknytning til minkproduktion

Denne opgørelse er baseret på SARS-CoV-2 PCR-positive prøver fra personer med kendt bopæl på

produktions- eller ejer-adresser for minkfarme, og inkluderer ikke sekvensresultater.

Som det fremgår af figur 3, ses en faldende forekomst af nye tilfælde af SARS-CoV-2 blandt personer med

tilknytning til minkproduktion i Region Nordjylland i uge 43-46, og samtidigt er forekomsten stærkt

stigende for Region Midtjylland fra uge 40, og i Region Syddanmark fra uge 43.

Figur 3:

Forekomst af PCR-positive prøver fra personer med bopæl på minkfarme og/eller ejer adresser pr.

uge, fordelt på regioner.

I alt er 27 % af personer med tilknytning til minkproduktion og deres husstandsmedlemmer blevet testet

positive for SARS-CoV-2 i Region Nordjylland, og tilsvarende tal er for Region Midtjylland 12% og 4% for

Region Syddanmark.

Som det ses af figur 4, har der i løbet af oktober været en forholdsvis beskeden andel af personer med

tilknytning til minkproduktion, som testede positive i Region Midtjylland og enkelte Syddanmark, hvorefter

antallet af smittede er begyndt at stige i november måned. I uge 46 var procent positive af testede 10 % i

Region Nordjylland, 33 % i Region Midtjylland, og 22 % i Region Syddanmark (figur 4). Til sammenligning er

den procent positive af testede i befolkningen som helhed ca. 1,5 % i uge 46. Der er altså fortsat en

betydelig risiko forbundet med at være medlem af en husstand med tilknytning til minkproduktion i

områder med smittede minkbesætninger.

Figur 4:

Antal testede og antal SARS-CoV-2-positive pr dag for personer med tilknytning til minkproduktion i

Region Nordjylland, Region Midtjylland og Region Syddanmark.

Regional forekomst af SARS-CoV-2 positive personer, sekventerede prøver og minkvariant Region

Nordjylland:

I Region Nordjylland ses en faldende forekomst af SARS-CoV-2 i befolkningen fra 817 i uge 44

til 588 i uge 45 til 486 i uge 46 (figur 3.a), og derudover er viser den relative forekomst af SARS-CoV-2

minkvarianter faldet tendens fra uge 41 til 45 (figur 3.b).

Figur 3.a:

Grå: Antal bekræftede tilfælde af SARS-CoV-2 i Region Nordjylland. Rød/gul: Antal sekventerede

prøver.

Figur 3.b:

Relativ fordeling mellem SARS-CoV-2 mink variant virus og andre typer pr. uge.

Region Midtjylland:

I Region Midtjylland har antallet af smittede personer været stigende de seneste uger,

med 1321 tilfælde i uge 45 og 1601 tilfælde af SARS-CoV-2-positive personer i uge 46 (figur 4.a). Det første

tilfælde med minkvarianten sås i uge 40, med en stigende tendens frem mod uge 45 (figur 4.b). Der

foreligger endnu ikke sekvensresultater for uge 46.

Figur 4.a:

Grå: Antal bekræftede tilfælde af SARS-CoV-2 i Region Midtjylland. Rød/gul: Antal sekventerede

prøver.

Figur 4.b:

Fordeling mellem SARS-CoV-2 mink variant virus og andre typer i Region Midtjylland.

Tabel 4:

Antal bekræftede tilfælde af SARS-CoV-2 fra uge 24-45, antal sekventerede prøver og antal tilfælde

af sekventerede prøver med SARS-CoV-2 mink variant virus, fordelt på regioner samt personer uden bopæl.

Region

Nordjylland

Midtjylland

Syddanmark

Sjælland

Hovedstaden

Turist/løs arb.

Total DK

Bekræftede SARS-CoV-2

4772

10455

7048

5807

23727

627

52436

Antal sekventerede

848

1454

1377

884

3503

8147

Antal minkvariant

292

373

Som det ses af tabel 5.a-f er antallet af påviste tilfælde af SARS-CoV-2 i de danske regioner steget hen over

efteråret. Dette skyldes formentlig både det øgede smittetryk og den øgede testaktivitet.

Andelen af prøver, der er blevet sekventeret varierede fra 5-38% mellem forskellige uger og regioner (tabel

5.a-f). Det estimerede antal tilfælde af minkvarianten er foretaget under en antagelse om, at andelen af

minkvarianter blandt sekventerede prøver er den samme for alle påviste tilfælde.

Tabel 5.a:

Hele Danmark, alle regioner samt personer uden bopæl.

Antal bekræftede SARS-CoV-2 tilfælde, antal sekventerede, herunder hvilken andel minkvarianten udgør af antal sekventerede

prøver, samt estimeret andel af tilfælde, forårsaget af minkvarianten.

Antal bekræftede

tilfælde

Antal

Sekventerede

Antal

Andel (%) af

bekræftede

24%

15%

32%

15%

13%

Antal

Minkvariant

Andel (%) af

sekventerede

(95% CI)

3% (3-4)

7% (5-10)

7% (5-8)

7% (5-11)

6% (4-7)

5% (4-6)

Estimeret antal tilfælde af

minkvarianten

Antal (95% CI)

Uge 24-40

Uge 41

Uge 42

Uge 43

Uge 44

Uge 45

18299

2689

3201

5845

7500

7376

4326

402

1022

299

1155

943

144

609 (515-715)

194 (131-274)

213 (167-268)

430 (273-639)

422 (328-534)

352 (258-467)

Tabel 5.b:

Region Nordjylland

Antal bekræftede SARS-CoV-2 tilfælde, antal sekventerede, herunder hvilken andel minkvarianten udgør af antal sekventerede

prøver, samt estimeret andel af tilfælde, forårsaget af minkvarianten.

Antal bekræftede

tilfælde

Antal

Sekventerede

Antal

Andel (%) af

bekræftede

27%

15%

35%

18%

13%

Antal

Minkvariant

Andel (%) af

sekventerede

(95% CI)

32% (28-37)

60% (44-74)

52% (43-61)

43% (27-60)

20% (14-28)

28% (18-39)

Estimeret antal tilfælde af

minkvarianten

Antal (95% CI)

Uge 24-40

Uge 41

Uge 42

Uge 43

Uge 44

Uge 45

1577

295

330

679

817

588

422

117

148

136

508 (438-582)

177 (131-219)

172 (141-203)

294 (184-410)

166 (115-226)

164 (108-230)

Minkvarianten blev påvist i 292 (34%) af i alt 848 sekventerede prøver i Region Nordjylland fra uge 24-45. I

ugerne 41-43 udgjorde minkvarianten ca. halvdelen af de sekventerede prøver (tabel 5.b), med en faldende

tendens i uge 44 og 45, hvilket faldt sammen med et fald i antal smittede farme i Region Nordjylland (figur

1).

I Region Midtjylland blev der kun meget sporadisk påvist SARS-CoV-2 minkvariant virus før uge 41 (tabel

5.c). Herefter steg antallet af påviste tilfælde med minkvarianten til omkring 10% i uge 44 og 45. Stigningen

faldt sammen med en stigning i antallet af smittede minkfarme i regionen (se ovenfor). Den største stigning

i antal smittede farme og personer med tilknytning til minkproduktion fandt sted i uge 46.

Sekvensresultater for uge 46 forventes medio uge 48.

Tabel 5.c:

Region Midtjylland

Antal bekræftede SARS-CoV-2 tilfælde, antal sekventerede, herunder hvilken andel minkvarianten udgør af antal sekventerede

prøver, samt estimeret andel af tilfælde, forårsaget af minkvarianten.

Antal bekræftede

tilfælde

Antal

Sekventerede

Antal

Andel (%) af

bekræftede

21%

14%

31%

14%

12%

Antal

Minkvariant

Andel (%) af

sekventerede

(95% CI)

0% (0-1)

2% (0-7)

3% (1-6)

6% (1-16)

12% (8-18)

9% (5-15)

Estimeret antal tilfælde af

minkvarianten

Antal (95% CI)

Uge 24-40

Uge 41

Uge 42

Uge 43

Uge 44

Uge 45

3597

769

678

1186

1293

1321

754

105

208

175

159

14 (3-42)

15 (2-52)

20 (7-42)

67 (14-186)

155 (98-230)

125 (71-199)

Tabel 5.d:

Region Syddanmark

Antal bekræftede SARS-CoV-2 tilfælde, antal sekventerede, herunder hvilken andel minkvarianten udgør af antal sekventerede

prøver, samt estimeret andel af tilfælde, forårsaget af minkvarianten.

Antal bekræftede

tilfælde

Antal

Sekventerede

Antal

Andel (%) af

bekræftede

38%

13%

27%

16%

12%

Antal

Minkvariant

Andel (%) af

sekventerede

(95% CI)

0% (0-0)

0% (0-7)

0% (0-2)

2% (0-12)

2% (0-5)

2% (1-7)

Estimeret antal tilfælde af

minkvarianten

Antal (95% CI)

Uge 24-40

Uge 41

Uge 42

Uge 43

Uge 44

Uge 45

2211

358

548

826

1024

990

846

148

168

123

0 (0-10)

0 (0-26)

0 (0-13)

19 (0-99)

18 (0-53)

24 (5-69)

I de øvrige regioner er der over de seneste uger påvist sporadiske forekomster af minkvarianten hos SARS-

CoV-2-smittede personer (5.d-f), hvilket indikerer en beskeden udbredelse uden for områder med smittede

minkbesætninger.

Tabel 5.e:

Region Sjælland

Antal bekræftede SARS-CoV-2 tilfælde, antal sekventerede, herunder hvilken andel minkvarianten udgør af antal sekventerede

prøver, samt estimeret andel af tilfælde, forårsaget af minkvarianten.

Antal bekræftede

tilfælde

Antal

Sekventerede

Antal

Andel (%) af

bekræftede

24%

12%

33%

16%

11%

Antal

Minkvariant

Andel (%) af

sekventerede

(95% CI)

0% (0-1)

0% (0-13)

0% (0-4)

6% (1-19)

3% (1-8)

2% (0-7)

Estimeret antal tilfælde af

minkvarianten

Antal (95% CI)

Uge 24-40

Uge 41

Uge 42

Uge 43

Uge 44

Uge 45

2053

226

279

537

829

985

493

129

108

4 (0-23)

0 (0-30)

0 (0-11)

30 (4-100)

26 (7-64)

18 (2-64)

Tabel 5.f:

Region Hovedstaden

Antal bekræftede SARS-CoV-2 tilfælde, antal sekventerede, herunder hvilken andel minkvarianten udgør af antal sekventerede

prøver, samt estimeret andel af tilfælde, forårsaget af minkvarianten.

Antal bekræftede

tilfælde

Antal

Sekventerede

Antal

Andel (%) af

bekræftede

20%

17%

34%

15%

14%

Antal

Minkvariant

Andel (%) af

sekventerede

(95% CI)

0% (0-0)

0% (0-2)

0% (0-1)

0% (0-3)

1% (1-3)

1% (0-2)

Estimeret antal tilfælde af

minkvarianten

Antal (95% CI)

Uge 24-40

Uge 41

Uge 42

Uge 43

Uge 44

Uge 45

8659

1019

1312

2540

3456

3414

1758

176

444

129

528

468

15 (3-43)

0 (0-21)

3 (0-16)

0 (0-72)

46 (18-94)

22 (5-64)

Beskrivelse af udbrud og påvisning med SARS-CoV-2 minkvariant virus, cluster 5

Cluster 5 er påvist i fem minkfarme i Region Nordjylland i august og september måned 2020, minkene på

alle de fem farme er nu aflivet. I alt 12 personer har fået påvist infektion med cluster 5 i Region Nordjylland,

heraf har otte personer været direkte tilknyttet fire af farmene enten som ejer, medarbejder elle

familiemedlem. I alt fire personer har ingen kendt tilknytning til minkfarme, men kommer fra samme

områder, hvor der har været smittede farme. De er påvist smittet i perioden fra ultimo august til d. 15.

september 2020. Alle personer har haft milde eller ingen symptomer.

Beskrivelse af farm med genfunden SARS-CoV-2 efter tidligere fritestning.

Den første farm (Farm 4) hvor minkene ikke blev slået ned efter infektion med SARS-CoV-2, blev første gang

testet positiv 11. august 2020 og blev fritestet ved undersøgelse af 300 svaberprøver ved PCR med negativt

resultat den 30. september 2020. Ved undersøgelse af prøver fra døde mink udtaget den 2. november

2020, blev der igen påvist SARS-CoV-2 ved PCR. På denne baggrund blev der udtaget mistankeprøver den 6.

november 2020, og der blev påvist SARS-CoV-2 i 26 ud af 35 svaberprøver. Seneste tidligere påvisning af

SARS-CoV-2 i prøver fra mink i besætningen var udtaget den 31. august 2020 hvor 6 ud af 24 svaberprøver

var positive i PCR.

Fylogenetisk analyse af sekvenserne viser, at prøverne fra november er mere relateret til tidligere

sekvenser fra samme farm end til nogen af de andre minkvariant clustre. Dette resultat kan indikere at virus

har været til stede på farmen siden august, og at den har videreudviklet sig derfra. Det kan dog ikke

udelukkes at der er tale om en reintroduktion af en tæt beslægtet variant af ukendt oprindelse.